LAMMPS

stable Öppen källkod

Molekyldynamik Tillgänglig

Kör LAMMPS på Slurm-baserad HPC hos WECORE: klassisk molekyldynamik från atomistiska till grovkorniga och mesoskaliga modeller, med rumslig uppdelning över MPI-ranker och GPU-acceleration.

Slurm GPU MPI

Boka en genomgång Prata med vårt team

Översikt

Lär känna LAMMPS.

LAMMPS är en klassisk molekyldynamikkod byggd kring rumslig uppdelning och ett mycket stort bibliotek av interatomära potentialer, från enkel Lennard-Jones via EAM och ReaxFF till maskininlärda potentialer.

Den är medvetet modulär. De flesta grupper använder den som en simuleringsmotor de skriptar, snarare än som en färdig applikation.

Användningsfall

Vad den används till.

Material under belastning

Följ sprickbildning, dislokationsdynamik och mekanisk respons med atomistisk upplösning, där en kontinuummodell slutar ge svar.

Tunna filmer och gränsytor

Simulera ytor, gränsytor och skiktade system, där strukturen vid gränsen styr hela systemets beteende.

Grovkorniga polymerer och mjuk materia

Nå tids- och längdskalor som en helatomsmodell inte klarar, inklusive granulära och mesoskaliga flöden.

Reaktiv kemi

Arbeta med ReaxFF och besläktade potentialer där bindningar bryts och bildas och en fast bindningstopologi inte räcker.

Körlägen

Så körs den på WECORE.

Slurm-batch

Slurm-batchjobb och arrayer

Skicka indataskript till kön och låt den rumsliga uppdelningen sprida simuleringsboxen över MPI-ranker, så att en modell som inte får plats på en nod körs över klustret. Parametersvep går ut som jobbarrayer.

GPU

GPU-avlastning för par- och grannberäkningar

GPU-paketen flyttar par- och grannberäkningarna till acceleratornoder överallt där potentialen stöder det. Det är oftast skillnaden mellan en körning som mäts i veckor och en som mäts i dagar.

Kommer snart

Ta med din simuleringsstack till ett moln du kontrollerar.

OpenFOAM, LAMMPS och GROMACS är redo nu, och resten av katalogen rullas ut. Begär tidig åtkomst och berätta vilken app du behöver härnäst.